此时年纪轻轻的张无忌，武功已经是当世数一数二，适逢围攻光明顶，明教陷于存亡之际，张无忌挺身而出，使出乾坤大挪移力挫六大门派，因为他的盖世武功，被明教上下推举为教主，领导明教走上反元的道路。

张无忌率领明教中人返回中原时，途中听闻六大派离开光明顶之后相继失踪，接着又巧遇女扮男装的正手持着，张无忌接受赵敏的邀请前往歇息，遭到赵敏的暗中下毒。张无忌为取解药，与赵敏双双坠进机关陷阱之中，二人肌肤相亲，赵敏对张无忌渐生爱意。

众人到达嵩山少林寺之后，惊见少林派遭人血洗，还嫁祸于明教，张无忌知道事态非比寻常，便赶往武当山去营救。在武当山上，张无忌得到太师父张三丰传授给他新创绝学和，将赵敏旗下的武林异人给击退。当得悉这一切乃赵敏所嫁祸时，张无忌便逼迫赵敏说出六大派的下落。

六大派因中了十香软筋散被囚禁在大都的万安寺，张无忌前往营救，其间遇见了光明右使，范遥使计从玄冥二老手中骗得十香软筋散的解药，让六大派中人回复内力，从万安寺脱险。

找到了冰火岛，将金毛狮王谢逊带往灵蛇岛，她骗得了屠龙刀欲与灭绝师太一决高下。后来得悉灭绝师太已死，便将新任峨嵋派掌门人周芷若掳走，张无忌、赵敏、小昭三人扮作舵工，前往灵蛇岛营救。

金花婆婆欲得到屠龙刀以报夫仇，便与谢逊交手决战，张无忌得悉金花婆婆的原来身分是明教四大护教法王之一的紫衫龙王。

波斯明教派来的风云三使─、、前来灵蛇岛捉拿黛绮丝，张无忌为保护义父而与风云三使过招，尽管他内力深厚，却对波斯的弄得一筹莫展。